Amb 17 anys, el 30 de novembre de 1537, va ingressar en l'orde franciscana en el Convent de Santa Maria de Jesús de València. Va ser ordenat sacerdot i va exercir de guardià dels convents de Sant Esperit de Gilet, Xelva, Vall de Jesús (prop de Puçol), Sant Blai de Sogorb i Bocairent, així com de mestre de novicis de la província franciscana de València fins l'any 1571, en què es va traslladar a Madrid com a director espiritual del Monestir de Santa Clara per sol·licitud expressa de Joana d'Habsburg.
Retrat d'un franciscà, a una col·lecció particular.
En els primers dies d'abril de 1582 va traslladar-se al convent de Santa Caterina d'Onda. Al novembre del mateix any es va traslladar a Barcelona al convent de Mont Calvari, d'on va tornar de nou, molt malalt, al de Santa Maria de Jesús a València cap a finals de 1583, on va morir.
Va ser conseller del patriarca Joan de Ribera i va mantenir lligams d'amistat amb el beat Joan dels Àngels, a Madrid, i amb Sant Lluís Bertran.
Conreà la música, la il·lustració de llibres i la pintura, seguint la línia manierista de Joan de Joanes però sense atènyer la perfecció d'aquest, deixant una obra de valor desigual.
La primera biografia de Nicolau Factor, Libro de la vida y obras maravillosas del Padre Fray Pedro Nicolás Factor de Cristóbal Moreno, va ser publicada l'any 1586.
